Ninguno de los favoritos fue capaz de situarse al frente de su respectiva clasificación tras completarse la primera jornada de entrenamientos del Gran Premio de Malasia, que se saldó con sorpresas en todos los frentes.
Al final, los mejores tiempos en cada una de las cilindradas correspondieron a Andrea Iannone, Hiroshi Aoyama y Colin Edwards. El italiano Andrea Iannone fue el primero en doblegar a los candidatos a la victoria en los 125 cc, en donde las dos vueltas finales le bastaron para relegar a la segunda plaza al húngaro Gabor Talmacsi, quien hasta esos momentos había sido el más rápido de la cilindrada.
En la primera línea también se colocaron provisionalmente Danny Webb y el español Pol Espargaró. En esta cilindrada se produjo el percance más relevante de la jornada al sufrir una fuerte y espectacular caída el español Marc Márquez, quien se quedó con sus piernas enganchadas en la KTM y requirió de la ayuda de los comisarios de pista para poder soltarse de la misma.
Moto GP. Tanto el italiano Valentino Rossi como el japonés Shinya Nakano estuvieron en algún momento al frente de la clasificación por tiempos, pero al final se vieron sorprendidos por el estadounidense Colin Edwards. El piloto americano entró en su taller para realizar un último cambio de neumático trasero y, gracias a esa decisión, volvió a la pista para batir el mejor tiempo, que estaba en poder de Rossi desde la sesión matinal.
Casey Stoner, que se quedó a algo más de 3 décimas de segundo de Edwards, acreditó al italiano Rossi como el más rápido en la ronda de entrenos -2:00.605-. Lorenzo fue el más rápido de los españoles.
